ทีมงานยังวิเคราะห์ว่ายีนใดเปิดและปิดหลังจากการติดเชื้อ SARS-CoV และ SARS-CoV-2 เพื่อทำความเข้าใจว่าเซลล์จากทางเดินหายใจของมนุษย์ตอบสนองต่อการติดเชื้ออย่างไร และโปรแกรมภูมิคุ้มกันโดยธรรมชาติใดที่เปิดใช้งาน ระบบภูมิคุ้มกันโดยกำเนิดเป็น "แนวป้องกันด่านแรก" ของร่างกายในการต่อต้านเชื้อโรคที่บุกรุกเข้ามา และมีความสำคัญอย่างยิ่งไม่เพียงแต่เพื่อกักกันผู้บุกรุกเท่านั้น แต่ยังสอนสาขาอื่นๆ ของระบบภูมิคุ้มกันถึงวิธีตอบสนองอย่างเหมาะสม เมื่อเลียนแบบสภาวะที่พบในทางเดิน หายใจ ส่วนบน (33°C) ทีมงานพบว่าการติดเชื้อ SARS-CoV-2 ไม่ได้กระตุ้นการตอบสนองของภูมิคุ้มกันโดยกำเนิดภายในเซลล์เหล่านี้รุนแรงเท่ากับเมื่อเลียนแบบสภาวะที่พบในทางเดินหายใจส่วนล่าง ทางเดินอาหาร (37°C) Dijkman กล่าวว่า "เนื่องจากความแข็งแกร่งของการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันโดยกำเนิดสามารถส่งผลโดยตรงต่อระดับการจำลองแบบของไวรัสได้ จึงอาจช่วยอธิบายได้ว่าทำไม SARS-CoV-2 จึงจำลองแบบได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้นในอุณหภูมิที่ต่ำกว่า"